SpeI-Erkennungssequenz

SpeI auf einen Blick

5' A|CTAGT 3'
3' TGATC|A 5'

So findest du SpeI-Schnittstellen in einer Sequenz

1. Füge oben eine DNA-Sequenz oder einen FASTA-Eintrag ein. SpeI steht schon unter Nur diese Enzyme.
2. Setze bei einem Plasmid das Häkchen bei Zirkuläre DNA, damit auch eine Stelle über Ende und Anfang hinweg gefunden wird.
3. Die Karte markiert jeden SpeI-Schnitt mit seiner Position. Das Ergebnis darunter kannst du kopieren oder herunterladen.

Häufige Fragen

Welche Sequenz schneidet SpeI?

SpeI erkennt ACTAGT (von 5' nach 3' geschrieben) und schneidet den oberen Strang bei A^CTAGT.

Erzeugt SpeI klebrige oder glatte Enden?

Klebrige Enden: überhängende 5'-Enden mit 4 Basen (CTAG).

Welche Enzyme erzeugen zu SpeI kompatible Enden?

AvrII, NheI und XbaI. Ihre Überhänge sind gleich, daher lassen sich die Enden miteinander ligieren.

Wie oft schneidet SpeI?

Eine Sequenz wie ACTAGT kommt etwa einmal alle 4.096 bp in zufälliger DNA vor. Echte Sequenzen weichen ab, prüfe deine also oben.