SphI-Erkennungssequenz
SphI auf einen Blick
5' GCATG|C 3' 3' C|GTACG 5'
| Erkennungssequenz | 5'-GCATGC-3' |
| Schnitt | GCATG^C |
| Enden | überhängende 3'-Enden mit 4 Basen (CATG) |
| Erwartete Häufigkeit | etwa einmal alle 4.096 bp in zufälliger DNA |
So findest du SphI-Schnittstellen in einer Sequenz
- Füge oben eine DNA-Sequenz oder einen FASTA-Eintrag ein. SphI steht schon unter Nur diese Enzyme.
- Setze bei einem Plasmid das Häkchen bei Zirkuläre DNA, damit auch eine Stelle über Ende und Anfang hinweg gefunden wird.
- Die Karte markiert jeden SphI-Schnitt mit seiner Position. Das Ergebnis darunter kannst du kopieren oder herunterladen.
Häufige Fragen
Welche Sequenz schneidet SphI?
SphI erkennt GCATGC (von 5' nach 3' geschrieben) und schneidet den oberen Strang bei GCATG^C.
Erzeugt SphI klebrige oder glatte Enden?
Klebrige Enden: überhängende 3'-Enden mit 4 Basen (CATG).
Wie oft schneidet SphI?
Eine Sequenz wie GCATGC kommt etwa einmal alle 4.096 bp in zufälliger DNA vor. Echte Sequenzen weichen ab, prüfe deine also oben.
Restriktionsenzyme
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