MspI-Erkennungssequenz
MspI auf einen Blick
5' C|CGG 3' 3' GGC|C 5'
| Erkennungssequenz | 5'-CCGG-3' |
| Schnitt | C^CGG |
| Enden | überhängende 5'-Enden mit 2 Basen (CG) |
| Erwartete Häufigkeit | etwa einmal alle 256 bp in zufälliger DNA |
| Kompatible Enden | BstBI, ClaI, TaqI |
So findest du MspI-Schnittstellen in einer Sequenz
- Füge oben eine DNA-Sequenz oder einen FASTA-Eintrag ein. MspI steht schon unter Nur diese Enzyme.
- Setze bei einem Plasmid das Häkchen bei Zirkuläre DNA, damit auch eine Stelle über Ende und Anfang hinweg gefunden wird.
- Die Karte markiert jeden MspI-Schnitt mit seiner Position. Das Ergebnis darunter kannst du kopieren oder herunterladen.
Häufige Fragen
Welche Sequenz schneidet MspI?
MspI erkennt CCGG (von 5' nach 3' geschrieben) und schneidet den oberen Strang bei C^CGG.
Erzeugt MspI klebrige oder glatte Enden?
Klebrige Enden: überhängende 5'-Enden mit 2 Basen (CG).
Welche Enzyme erzeugen zu MspI kompatible Enden?
BstBI, ClaI und TaqI. Ihre Überhänge sind gleich, daher lassen sich die Enden miteinander ligieren.
Wie oft schneidet MspI?
Eine Sequenz wie CCGG kommt etwa einmal alle 256 bp in zufälliger DNA vor. Echte Sequenzen weichen ab, prüfe deine also oben.
Restriktionsenzyme
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