AscI-Erkennungssequenz

AscI auf einen Blick

5' GG|CGCGCC 3'
3' CCGCGC|GG 5'

So findest du AscI-Schnittstellen in einer Sequenz

1. Füge oben eine DNA-Sequenz oder einen FASTA-Eintrag ein. AscI steht schon unter Nur diese Enzyme.
2. Setze bei einem Plasmid das Häkchen bei Zirkuläre DNA, damit auch eine Stelle über Ende und Anfang hinweg gefunden wird.
3. Die Karte markiert jeden AscI-Schnitt mit seiner Position. Das Ergebnis darunter kannst du kopieren oder herunterladen.

Häufige Fragen

Welche Sequenz schneidet AscI?

AscI erkennt GGCGCGCC (von 5' nach 3' geschrieben) und schneidet den oberen Strang bei GG^CGCGCC.

Erzeugt AscI klebrige oder glatte Enden?

Klebrige Enden: überhängende 5'-Enden mit 4 Basen (CGCG).

Welche Enzyme erzeugen zu AscI kompatible Enden?

BssHII und MluI. Ihre Überhänge sind gleich, daher lassen sich die Enden miteinander ligieren.

Wie oft schneidet AscI?

Eine Sequenz wie GGCGCGCC kommt etwa einmal alle 65.536 bp in zufälliger DNA vor. Echte Sequenzen weichen ab, prüfe deine also oben.