HpaI-Erkennungssequenz
HpaI auf einen Blick
5' GTT|AAC 3' 3' CAA|TTG 5'
| Erkennungssequenz | 5'-GTTAAC-3' |
| Schnitt | GTT^AAC |
| Enden | glatte Enden |
| Erwartete Häufigkeit | etwa einmal alle 4.096 bp in zufälliger DNA |
So findest du HpaI-Schnittstellen in einer Sequenz
- Füge oben eine DNA-Sequenz oder einen FASTA-Eintrag ein. HpaI steht schon unter Nur diese Enzyme.
- Setze bei einem Plasmid das Häkchen bei Zirkuläre DNA, damit auch eine Stelle über Ende und Anfang hinweg gefunden wird.
- Die Karte markiert jeden HpaI-Schnitt mit seiner Position. Das Ergebnis darunter kannst du kopieren oder herunterladen.
Häufige Fragen
Welche Sequenz schneidet HpaI?
HpaI erkennt GTTAAC (von 5' nach 3' geschrieben) und schneidet den oberen Strang bei GTT^AAC.
Erzeugt HpaI klebrige oder glatte Enden?
Glatte Enden ohne Überhang.
Wie oft schneidet HpaI?
Eine Sequenz wie GTTAAC kommt etwa einmal alle 4.096 bp in zufälliger DNA vor. Echte Sequenzen weichen ab, prüfe deine also oben.
Restriktionsenzyme
RestriktionskarteAatII-ErkennungssequenzAccI-ErkennungssequenzAflII-ErkennungssequenzAgeI-ErkennungssequenzAluI-ErkennungssequenzApaI-ErkennungssequenzApaLI-ErkennungssequenzAscI-ErkennungssequenzAvaI-ErkennungssequenzAvrII-ErkennungssequenzBamHI-ErkennungssequenzBclI-ErkennungssequenzBglII-ErkennungssequenzBsiWI-ErkennungssequenzBspHI-ErkennungssequenzBsrGI-ErkennungssequenzBssHII-ErkennungssequenzBstBI-ErkennungssequenzClaI-ErkennungssequenzDraI-ErkennungssequenzEagI-ErkennungssequenzEcoRI-ErkennungssequenzEcoRV-ErkennungssequenzFseI-ErkennungssequenzHaeIII-ErkennungssequenzHhaI-ErkennungssequenzHincII-ErkennungssequenzHindIII-ErkennungssequenzHinfI-ErkennungssequenzKpnI-ErkennungssequenzMfeI-ErkennungssequenzMluI-ErkennungssequenzMseI-ErkennungssequenzMspI-ErkennungssequenzNaeI-ErkennungssequenzNcoI-ErkennungssequenzNdeI-ErkennungssequenzNheI-ErkennungssequenzNotI-ErkennungssequenzNruI-ErkennungssequenzNsiI-ErkennungssequenzPacI-ErkennungssequenzPmeI-ErkennungssequenzPstI-ErkennungssequenzPvuI-ErkennungssequenzPvuII-ErkennungssequenzRsaI-ErkennungssequenzSacI-ErkennungssequenzSacII-ErkennungssequenzSalI-ErkennungssequenzSau3AI-ErkennungssequenzScaI-ErkennungssequenzSfiI-ErkennungssequenzSmaI-ErkennungssequenzSnaBI-ErkennungssequenzSpeI-ErkennungssequenzSphI-ErkennungssequenzSspI-ErkennungssequenzStuI-ErkennungssequenzSwaI-ErkennungssequenzTaqI-ErkennungssequenzXbaI-ErkennungssequenzXhoI-ErkennungssequenzXmaI-Erkennungssequenz
Weitere DNA- und Proteinsequenz-Tools
Reverses KomplementDNA zu RNAFASTA-Sequenzen verbindenFASTA-Sequenz aufteilenGenBank zu FASTAEMBL zu FASTAGenBank-Feature-ExtraktorEMBL-Feature-ExtraktorGenBank-Translation-ExtraktorEMBL-Translation-ExtraktorIn Codons teilenBereiche aus DNA extrahierenBereiche aus Protein extrahierenDNA-Fenster extrahierenProtein-Fenster extrahierenDNA bereinigenProtein bereinigenDNA gruppierenProtein gruppierenAminosäuren: Ein- zu DreibuchstabencodeAminosäuren: Drei- zu EinbuchstabencodeDNA-StatistikProtein-StatistikCodon-UsageCpG-Insel-FinderDNA-MolekulargewichtProtein-MolekulargewichtIsoelektrischer Punkt von ProteinenProtein-GRAVYMuster in DNA findenMuster in Protein findenUnscharfe DNA-SucheUnscharfe ProteinsucheIdentität und ÄhnlichkeitORF-FinderDNA in Protein übersetzenRückübersetzungProtein-Alignment zurückübersetzenPCR-Primer-AnalysePCR-ProdukteRestriktionsübersichtSchnittstelle durch MutationZwei DNA-Sequenzen alignierenZwei Proteine alignierenCodons alignierenCodon-OptimierungCRISPR-Guide-FinderTranslationskartePrimer-KarteAlignment nach Konservierung färbenAlignment nach Eigenschaften färbenCodon-PlotPlasmidkarte anzeigenZufällige DNA-SequenzZufällige ProteinsequenzZufällige kodierende DNAZufällige DNA-BereicheZufällige ProteinbereicheDNA-StichprobeProtein-StichprobeDNA mischenProtein mischenDNA mutierenProtein mutierenGenetische CodesIUPAC-Codes