Toolyard

BamHI-Erkennungssequenz


BamHI auf einen Blick

5' G|GATCC 3'
3' CCTAG|G 5'
Erkennungssequenz5'-GGATCC-3'
SchnittG^GATCC
Endenüberhängende 5'-Enden mit 4 Basen (GATC)
Erwartete Häufigkeitetwa einmal alle 4.096 bp in zufälliger DNA
Kompatible EndenBclI, BglII, Sau3AI

So findest du BamHI-Schnittstellen in einer Sequenz

  1. Füge oben eine DNA-Sequenz oder einen FASTA-Eintrag ein. BamHI steht schon unter Nur diese Enzyme.
  2. Setze bei einem Plasmid das Häkchen bei Zirkuläre DNA, damit auch eine Stelle über Ende und Anfang hinweg gefunden wird.
  3. Die Karte markiert jeden BamHI-Schnitt mit seiner Position. Das Ergebnis darunter kannst du kopieren oder herunterladen.

Häufige Fragen

Welche Sequenz schneidet BamHI?

BamHI erkennt GGATCC (von 5' nach 3' geschrieben) und schneidet den oberen Strang bei G^GATCC.

Erzeugt BamHI klebrige oder glatte Enden?

Klebrige Enden: überhängende 5'-Enden mit 4 Basen (GATC).

Welche Enzyme erzeugen zu BamHI kompatible Enden?

BclI, BglII und Sau3AI. Ihre Überhänge sind gleich, daher lassen sich die Enden miteinander ligieren.

Wie oft schneidet BamHI?

Eine Sequenz wie GGATCC kommt etwa einmal alle 4.096 bp in zufälliger DNA vor. Echte Sequenzen weichen ab, prüfe deine also oben.

Restriktionsenzyme

Weitere DNA- und Proteinsequenz-Tools

Anleitungen