PvuI-Erkennungssequenz

PvuI auf einen Blick

5' CGAT|CG 3'
3' GC|TAGC 5'

So findest du PvuI-Schnittstellen in einer Sequenz

1. Füge oben eine DNA-Sequenz oder einen FASTA-Eintrag ein. PvuI steht schon unter Nur diese Enzyme.
2. Setze bei einem Plasmid das Häkchen bei Zirkuläre DNA, damit auch eine Stelle über Ende und Anfang hinweg gefunden wird.
3. Die Karte markiert jeden PvuI-Schnitt mit seiner Position. Das Ergebnis darunter kannst du kopieren oder herunterladen.

Häufige Fragen

Welche Sequenz schneidet PvuI?

PvuI erkennt CGATCG (von 5' nach 3' geschrieben) und schneidet den oberen Strang bei CGAT^CG.

Erzeugt PvuI klebrige oder glatte Enden?

Klebrige Enden: überhängende 3'-Enden mit 2 Basen (AT).

Welche Enzyme erzeugen zu PvuI kompatible Enden?

PacI. Ihre Überhänge sind gleich, daher lassen sich die Enden miteinander ligieren.

Wie oft schneidet PvuI?

Eine Sequenz wie CGATCG kommt etwa einmal alle 4.096 bp in zufälliger DNA vor. Echte Sequenzen weichen ab, prüfe deine also oben.