Sau3AI-Erkennungssequenz

Sau3AI auf einen Blick

5' |GATC 3'
3' CTAG| 5'

So findest du Sau3AI-Schnittstellen in einer Sequenz

1. Füge oben eine DNA-Sequenz oder einen FASTA-Eintrag ein. Sau3AI steht schon unter Nur diese Enzyme.
2. Setze bei einem Plasmid das Häkchen bei Zirkuläre DNA, damit auch eine Stelle über Ende und Anfang hinweg gefunden wird.
3. Die Karte markiert jeden Sau3AI-Schnitt mit seiner Position. Das Ergebnis darunter kannst du kopieren oder herunterladen.

Häufige Fragen

Welche Sequenz schneidet Sau3AI?

Sau3AI erkennt GATC (von 5' nach 3' geschrieben) und schneidet den oberen Strang bei ^GATC.

Erzeugt Sau3AI klebrige oder glatte Enden?

Klebrige Enden: überhängende 5'-Enden mit 4 Basen (GATC).

Welche Enzyme erzeugen zu Sau3AI kompatible Enden?

BamHI, BclI und BglII. Ihre Überhänge sind gleich, daher lassen sich die Enden miteinander ligieren.

Wie oft schneidet Sau3AI?

Eine Sequenz wie GATC kommt etwa einmal alle 256 bp in zufälliger DNA vor. Echte Sequenzen weichen ab, prüfe deine also oben.