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MfeI-Erkennungssequenz


MfeI auf einen Blick

5' C|AATTG 3'
3' GTTAA|C 5'
Erkennungssequenz5'-CAATTG-3'
SchnittC^AATTG
Endenüberhängende 5'-Enden mit 4 Basen (AATT)
Erwartete Häufigkeitetwa einmal alle 4.096 bp in zufälliger DNA
Kompatible EndenEcoRI

So findest du MfeI-Schnittstellen in einer Sequenz

  1. Füge oben eine DNA-Sequenz oder einen FASTA-Eintrag ein. MfeI steht schon unter Nur diese Enzyme.
  2. Setze bei einem Plasmid das Häkchen bei Zirkuläre DNA, damit auch eine Stelle über Ende und Anfang hinweg gefunden wird.
  3. Die Karte markiert jeden MfeI-Schnitt mit seiner Position. Das Ergebnis darunter kannst du kopieren oder herunterladen.

Häufige Fragen

Welche Sequenz schneidet MfeI?

MfeI erkennt CAATTG (von 5' nach 3' geschrieben) und schneidet den oberen Strang bei C^AATTG.

Erzeugt MfeI klebrige oder glatte Enden?

Klebrige Enden: überhängende 5'-Enden mit 4 Basen (AATT).

Welche Enzyme erzeugen zu MfeI kompatible Enden?

EcoRI. Ihre Überhänge sind gleich, daher lassen sich die Enden miteinander ligieren.

Wie oft schneidet MfeI?

Eine Sequenz wie CAATTG kommt etwa einmal alle 4.096 bp in zufälliger DNA vor. Echte Sequenzen weichen ab, prüfe deine also oben.

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