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HindIII-Erkennungssequenz


HindIII auf einen Blick

5' A|AGCTT 3'
3' TTCGA|A 5'
Erkennungssequenz5'-AAGCTT-3'
SchnittA^AGCTT
Endenüberhängende 5'-Enden mit 4 Basen (AGCT)
Erwartete Häufigkeitetwa einmal alle 4.096 bp in zufälliger DNA

So findest du HindIII-Schnittstellen in einer Sequenz

  1. Füge oben eine DNA-Sequenz oder einen FASTA-Eintrag ein. HindIII steht schon unter Nur diese Enzyme.
  2. Setze bei einem Plasmid das Häkchen bei Zirkuläre DNA, damit auch eine Stelle über Ende und Anfang hinweg gefunden wird.
  3. Die Karte markiert jeden HindIII-Schnitt mit seiner Position. Das Ergebnis darunter kannst du kopieren oder herunterladen.

Häufige Fragen

Welche Sequenz schneidet HindIII?

HindIII erkennt AAGCTT (von 5' nach 3' geschrieben) und schneidet den oberen Strang bei A^AGCTT.

Erzeugt HindIII klebrige oder glatte Enden?

Klebrige Enden: überhängende 5'-Enden mit 4 Basen (AGCT).

Wie oft schneidet HindIII?

Eine Sequenz wie AAGCTT kommt etwa einmal alle 4.096 bp in zufälliger DNA vor. Echte Sequenzen weichen ab, prüfe deine also oben.

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