ApaLI-Erkennungssequenz
ApaLI auf einen Blick
5' G|TGCAC 3' 3' CACGT|G 5'
| Erkennungssequenz | 5'-GTGCAC-3' |
| Schnitt | G^TGCAC |
| Enden | überhängende 5'-Enden mit 4 Basen (TGCA) |
| Erwartete Häufigkeit | etwa einmal alle 4.096 bp in zufälliger DNA |
So findest du ApaLI-Schnittstellen in einer Sequenz
- Füge oben eine DNA-Sequenz oder einen FASTA-Eintrag ein. ApaLI steht schon unter Nur diese Enzyme.
- Setze bei einem Plasmid das Häkchen bei Zirkuläre DNA, damit auch eine Stelle über Ende und Anfang hinweg gefunden wird.
- Die Karte markiert jeden ApaLI-Schnitt mit seiner Position. Das Ergebnis darunter kannst du kopieren oder herunterladen.
Häufige Fragen
Welche Sequenz schneidet ApaLI?
ApaLI erkennt GTGCAC (von 5' nach 3' geschrieben) und schneidet den oberen Strang bei G^TGCAC.
Erzeugt ApaLI klebrige oder glatte Enden?
Klebrige Enden: überhängende 5'-Enden mit 4 Basen (TGCA).
Wie oft schneidet ApaLI?
Eine Sequenz wie GTGCAC kommt etwa einmal alle 4.096 bp in zufälliger DNA vor. Echte Sequenzen weichen ab, prüfe deine also oben.
Restriktionsenzyme
RestriktionskarteAatII-ErkennungssequenzAccI-ErkennungssequenzAflII-ErkennungssequenzAgeI-ErkennungssequenzAluI-ErkennungssequenzApaI-ErkennungssequenzAscI-ErkennungssequenzAvaI-ErkennungssequenzAvrII-ErkennungssequenzBamHI-ErkennungssequenzBclI-ErkennungssequenzBglII-ErkennungssequenzBsiWI-ErkennungssequenzBspHI-ErkennungssequenzBsrGI-ErkennungssequenzBssHII-ErkennungssequenzBstBI-ErkennungssequenzClaI-ErkennungssequenzDraI-ErkennungssequenzEagI-ErkennungssequenzEcoRI-ErkennungssequenzEcoRV-ErkennungssequenzFseI-ErkennungssequenzHaeIII-ErkennungssequenzHhaI-ErkennungssequenzHincII-ErkennungssequenzHindIII-ErkennungssequenzHinfI-ErkennungssequenzHpaI-ErkennungssequenzKpnI-ErkennungssequenzMfeI-ErkennungssequenzMluI-ErkennungssequenzMseI-ErkennungssequenzMspI-ErkennungssequenzNaeI-ErkennungssequenzNcoI-ErkennungssequenzNdeI-ErkennungssequenzNheI-ErkennungssequenzNotI-ErkennungssequenzNruI-ErkennungssequenzNsiI-ErkennungssequenzPacI-ErkennungssequenzPmeI-ErkennungssequenzPstI-ErkennungssequenzPvuI-ErkennungssequenzPvuII-ErkennungssequenzRsaI-ErkennungssequenzSacI-ErkennungssequenzSacII-ErkennungssequenzSalI-ErkennungssequenzSau3AI-ErkennungssequenzScaI-ErkennungssequenzSfiI-ErkennungssequenzSmaI-ErkennungssequenzSnaBI-ErkennungssequenzSpeI-ErkennungssequenzSphI-ErkennungssequenzSspI-ErkennungssequenzStuI-ErkennungssequenzSwaI-ErkennungssequenzTaqI-ErkennungssequenzXbaI-ErkennungssequenzXhoI-ErkennungssequenzXmaI-Erkennungssequenz
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