PacI-Erkennungssequenz
PacI auf einen Blick
5' TTAAT|TAA 3' 3' AAT|TAATT 5'
| Erkennungssequenz | 5'-TTAATTAA-3' |
| Schnitt | TTAAT^TAA |
| Enden | überhängende 3'-Enden mit 2 Basen (AT) |
| Erwartete Häufigkeit | etwa einmal alle 65.536 bp in zufälliger DNA |
| Kompatible Enden | PvuI |
So findest du PacI-Schnittstellen in einer Sequenz
- Füge oben eine DNA-Sequenz oder einen FASTA-Eintrag ein. PacI steht schon unter Nur diese Enzyme.
- Setze bei einem Plasmid das Häkchen bei Zirkuläre DNA, damit auch eine Stelle über Ende und Anfang hinweg gefunden wird.
- Die Karte markiert jeden PacI-Schnitt mit seiner Position. Das Ergebnis darunter kannst du kopieren oder herunterladen.
Häufige Fragen
Welche Sequenz schneidet PacI?
PacI erkennt TTAATTAA (von 5' nach 3' geschrieben) und schneidet den oberen Strang bei TTAAT^TAA.
Erzeugt PacI klebrige oder glatte Enden?
Klebrige Enden: überhängende 3'-Enden mit 2 Basen (AT).
Welche Enzyme erzeugen zu PacI kompatible Enden?
PvuI. Ihre Überhänge sind gleich, daher lassen sich die Enden miteinander ligieren.
Wie oft schneidet PacI?
Eine Sequenz wie TTAATTAA kommt etwa einmal alle 65.536 bp in zufälliger DNA vor. Echte Sequenzen weichen ab, prüfe deine also oben.
Restriktionsenzyme
RestriktionskarteAatII-ErkennungssequenzAccI-ErkennungssequenzAflII-ErkennungssequenzAgeI-ErkennungssequenzAluI-ErkennungssequenzApaI-ErkennungssequenzApaLI-ErkennungssequenzAscI-ErkennungssequenzAvaI-ErkennungssequenzAvrII-ErkennungssequenzBamHI-ErkennungssequenzBclI-ErkennungssequenzBglII-ErkennungssequenzBsiWI-ErkennungssequenzBspHI-ErkennungssequenzBsrGI-ErkennungssequenzBssHII-ErkennungssequenzBstBI-ErkennungssequenzClaI-ErkennungssequenzDraI-ErkennungssequenzEagI-ErkennungssequenzEcoRI-ErkennungssequenzEcoRV-ErkennungssequenzFseI-ErkennungssequenzHaeIII-ErkennungssequenzHhaI-ErkennungssequenzHincII-ErkennungssequenzHindIII-ErkennungssequenzHinfI-ErkennungssequenzHpaI-ErkennungssequenzKpnI-ErkennungssequenzMfeI-ErkennungssequenzMluI-ErkennungssequenzMseI-ErkennungssequenzMspI-ErkennungssequenzNaeI-ErkennungssequenzNcoI-ErkennungssequenzNdeI-ErkennungssequenzNheI-ErkennungssequenzNotI-ErkennungssequenzNruI-ErkennungssequenzNsiI-ErkennungssequenzPmeI-ErkennungssequenzPstI-ErkennungssequenzPvuI-ErkennungssequenzPvuII-ErkennungssequenzRsaI-ErkennungssequenzSacI-ErkennungssequenzSacII-ErkennungssequenzSalI-ErkennungssequenzSau3AI-ErkennungssequenzScaI-ErkennungssequenzSfiI-ErkennungssequenzSmaI-ErkennungssequenzSnaBI-ErkennungssequenzSpeI-ErkennungssequenzSphI-ErkennungssequenzSspI-ErkennungssequenzStuI-ErkennungssequenzSwaI-ErkennungssequenzTaqI-ErkennungssequenzXbaI-ErkennungssequenzXhoI-ErkennungssequenzXmaI-Erkennungssequenz
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