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BsrGI-Erkennungssequenz


BsrGI auf einen Blick

5' T|GTACA 3'
3' ACATG|T 5'
Erkennungssequenz5'-TGTACA-3'
SchnittT^GTACA
Endenüberhängende 5'-Enden mit 4 Basen (GTAC)
Erwartete Häufigkeitetwa einmal alle 4.096 bp in zufälliger DNA
Kompatible EndenBsiWI

So findest du BsrGI-Schnittstellen in einer Sequenz

  1. Füge oben eine DNA-Sequenz oder einen FASTA-Eintrag ein. BsrGI steht schon unter Nur diese Enzyme.
  2. Setze bei einem Plasmid das Häkchen bei Zirkuläre DNA, damit auch eine Stelle über Ende und Anfang hinweg gefunden wird.
  3. Die Karte markiert jeden BsrGI-Schnitt mit seiner Position. Das Ergebnis darunter kannst du kopieren oder herunterladen.

Häufige Fragen

Welche Sequenz schneidet BsrGI?

BsrGI erkennt TGTACA (von 5' nach 3' geschrieben) und schneidet den oberen Strang bei T^GTACA.

Erzeugt BsrGI klebrige oder glatte Enden?

Klebrige Enden: überhängende 5'-Enden mit 4 Basen (GTAC).

Welche Enzyme erzeugen zu BsrGI kompatible Enden?

BsiWI. Ihre Überhänge sind gleich, daher lassen sich die Enden miteinander ligieren.

Wie oft schneidet BsrGI?

Eine Sequenz wie TGTACA kommt etwa einmal alle 4.096 bp in zufälliger DNA vor. Echte Sequenzen weichen ab, prüfe deine also oben.

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