PstI-Erkennungssequenz
PstI auf einen Blick
5' CTGCA|G 3' 3' G|ACGTC 5'
| Erkennungssequenz | 5'-CTGCAG-3' |
| Schnitt | CTGCA^G |
| Enden | überhängende 3'-Enden mit 4 Basen (TGCA) |
| Erwartete Häufigkeit | etwa einmal alle 4.096 bp in zufälliger DNA |
| Kompatible Enden | NsiI |
So findest du PstI-Schnittstellen in einer Sequenz
- Füge oben eine DNA-Sequenz oder einen FASTA-Eintrag ein. PstI steht schon unter Nur diese Enzyme.
- Setze bei einem Plasmid das Häkchen bei Zirkuläre DNA, damit auch eine Stelle über Ende und Anfang hinweg gefunden wird.
- Die Karte markiert jeden PstI-Schnitt mit seiner Position. Das Ergebnis darunter kannst du kopieren oder herunterladen.
Häufige Fragen
Welche Sequenz schneidet PstI?
PstI erkennt CTGCAG (von 5' nach 3' geschrieben) und schneidet den oberen Strang bei CTGCA^G.
Erzeugt PstI klebrige oder glatte Enden?
Klebrige Enden: überhängende 3'-Enden mit 4 Basen (TGCA).
Welche Enzyme erzeugen zu PstI kompatible Enden?
NsiI. Ihre Überhänge sind gleich, daher lassen sich die Enden miteinander ligieren.
Wie oft schneidet PstI?
Eine Sequenz wie CTGCAG kommt etwa einmal alle 4.096 bp in zufälliger DNA vor. Echte Sequenzen weichen ab, prüfe deine also oben.
Restriktionsenzyme
RestriktionskarteAatII-ErkennungssequenzAccI-ErkennungssequenzAflII-ErkennungssequenzAgeI-ErkennungssequenzAluI-ErkennungssequenzApaI-ErkennungssequenzApaLI-ErkennungssequenzAscI-ErkennungssequenzAvaI-ErkennungssequenzAvrII-ErkennungssequenzBamHI-ErkennungssequenzBclI-ErkennungssequenzBglII-ErkennungssequenzBsiWI-ErkennungssequenzBspHI-ErkennungssequenzBsrGI-ErkennungssequenzBssHII-ErkennungssequenzBstBI-ErkennungssequenzClaI-ErkennungssequenzDraI-ErkennungssequenzEagI-ErkennungssequenzEcoRI-ErkennungssequenzEcoRV-ErkennungssequenzFseI-ErkennungssequenzHaeIII-ErkennungssequenzHhaI-ErkennungssequenzHincII-ErkennungssequenzHindIII-ErkennungssequenzHinfI-ErkennungssequenzHpaI-ErkennungssequenzKpnI-ErkennungssequenzMfeI-ErkennungssequenzMluI-ErkennungssequenzMseI-ErkennungssequenzMspI-ErkennungssequenzNaeI-ErkennungssequenzNcoI-ErkennungssequenzNdeI-ErkennungssequenzNheI-ErkennungssequenzNotI-ErkennungssequenzNruI-ErkennungssequenzNsiI-ErkennungssequenzPacI-ErkennungssequenzPmeI-ErkennungssequenzPvuI-ErkennungssequenzPvuII-ErkennungssequenzRsaI-ErkennungssequenzSacI-ErkennungssequenzSacII-ErkennungssequenzSalI-ErkennungssequenzSau3AI-ErkennungssequenzScaI-ErkennungssequenzSfiI-ErkennungssequenzSmaI-ErkennungssequenzSnaBI-ErkennungssequenzSpeI-ErkennungssequenzSphI-ErkennungssequenzSspI-ErkennungssequenzStuI-ErkennungssequenzSwaI-ErkennungssequenzTaqI-ErkennungssequenzXbaI-ErkennungssequenzXhoI-ErkennungssequenzXmaI-Erkennungssequenz
Weitere DNA- und Proteinsequenz-Tools
Reverses KomplementDNA zu RNAFASTA-Sequenzen verbindenFASTA-Sequenz aufteilenGenBank zu FASTAEMBL zu FASTAGenBank-Feature-ExtraktorEMBL-Feature-ExtraktorGenBank-Translation-ExtraktorEMBL-Translation-ExtraktorIn Codons teilenBereiche aus DNA extrahierenBereiche aus Protein extrahierenDNA-Fenster extrahierenProtein-Fenster extrahierenDNA bereinigenProtein bereinigenDNA gruppierenProtein gruppierenAminosäuren: Ein- zu DreibuchstabencodeAminosäuren: Drei- zu EinbuchstabencodeDNA-StatistikProtein-StatistikCodon-UsageCpG-Insel-FinderDNA-MolekulargewichtProtein-MolekulargewichtIsoelektrischer Punkt von ProteinenProtein-GRAVYMuster in DNA findenMuster in Protein findenUnscharfe DNA-SucheUnscharfe ProteinsucheIdentität und ÄhnlichkeitORF-FinderDNA in Protein übersetzenRückübersetzungProtein-Alignment zurückübersetzenPCR-Primer-AnalysePCR-ProdukteRestriktionsübersichtSchnittstelle durch MutationZwei DNA-Sequenzen alignierenZwei Proteine alignierenCodons alignierenCodon-OptimierungCRISPR-Guide-FinderTranslationskartePrimer-KarteAlignment nach Konservierung färbenAlignment nach Eigenschaften färbenCodon-PlotPlasmidkarte anzeigenZufällige DNA-SequenzZufällige ProteinsequenzZufällige kodierende DNAZufällige DNA-BereicheZufällige ProteinbereicheDNA-StichprobeProtein-StichprobeDNA mischenProtein mischenDNA mutierenProtein mutierenGenetische CodesIUPAC-Codes