EcoRI-Erkennungssequenz
EcoRI auf einen Blick
5' G|AATTC 3' 3' CTTAA|G 5'
| Erkennungssequenz | 5'-GAATTC-3' |
| Schnitt | G^AATTC |
| Enden | überhängende 5'-Enden mit 4 Basen (AATT) |
| Erwartete Häufigkeit | etwa einmal alle 4.096 bp in zufälliger DNA |
| Kompatible Enden | MfeI |
So findest du EcoRI-Schnittstellen in einer Sequenz
- Füge oben eine DNA-Sequenz oder einen FASTA-Eintrag ein. EcoRI steht schon unter Nur diese Enzyme.
- Setze bei einem Plasmid das Häkchen bei Zirkuläre DNA, damit auch eine Stelle über Ende und Anfang hinweg gefunden wird.
- Die Karte markiert jeden EcoRI-Schnitt mit seiner Position. Das Ergebnis darunter kannst du kopieren oder herunterladen.
Häufige Fragen
Welche Sequenz schneidet EcoRI?
EcoRI erkennt GAATTC (von 5' nach 3' geschrieben) und schneidet den oberen Strang bei G^AATTC.
Erzeugt EcoRI klebrige oder glatte Enden?
Klebrige Enden: überhängende 5'-Enden mit 4 Basen (AATT).
Welche Enzyme erzeugen zu EcoRI kompatible Enden?
MfeI. Ihre Überhänge sind gleich, daher lassen sich die Enden miteinander ligieren.
Wie oft schneidet EcoRI?
Eine Sequenz wie GAATTC kommt etwa einmal alle 4.096 bp in zufälliger DNA vor. Echte Sequenzen weichen ab, prüfe deine also oben.
Restriktionsenzyme
RestriktionskarteAatII-ErkennungssequenzAccI-ErkennungssequenzAflII-ErkennungssequenzAgeI-ErkennungssequenzAluI-ErkennungssequenzApaI-ErkennungssequenzApaLI-ErkennungssequenzAscI-ErkennungssequenzAvaI-ErkennungssequenzAvrII-ErkennungssequenzBamHI-ErkennungssequenzBclI-ErkennungssequenzBglII-ErkennungssequenzBsiWI-ErkennungssequenzBspHI-ErkennungssequenzBsrGI-ErkennungssequenzBssHII-ErkennungssequenzBstBI-ErkennungssequenzClaI-ErkennungssequenzDraI-ErkennungssequenzEagI-ErkennungssequenzEcoRV-ErkennungssequenzFseI-ErkennungssequenzHaeIII-ErkennungssequenzHhaI-ErkennungssequenzHincII-ErkennungssequenzHindIII-ErkennungssequenzHinfI-ErkennungssequenzHpaI-ErkennungssequenzKpnI-ErkennungssequenzMfeI-ErkennungssequenzMluI-ErkennungssequenzMseI-ErkennungssequenzMspI-ErkennungssequenzNaeI-ErkennungssequenzNcoI-ErkennungssequenzNdeI-ErkennungssequenzNheI-ErkennungssequenzNotI-ErkennungssequenzNruI-ErkennungssequenzNsiI-ErkennungssequenzPacI-ErkennungssequenzPmeI-ErkennungssequenzPstI-ErkennungssequenzPvuI-ErkennungssequenzPvuII-ErkennungssequenzRsaI-ErkennungssequenzSacI-ErkennungssequenzSacII-ErkennungssequenzSalI-ErkennungssequenzSau3AI-ErkennungssequenzScaI-ErkennungssequenzSfiI-ErkennungssequenzSmaI-ErkennungssequenzSnaBI-ErkennungssequenzSpeI-ErkennungssequenzSphI-ErkennungssequenzSspI-ErkennungssequenzStuI-ErkennungssequenzSwaI-ErkennungssequenzTaqI-ErkennungssequenzXbaI-ErkennungssequenzXhoI-ErkennungssequenzXmaI-Erkennungssequenz
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