AluI-Erkennungssequenz
AluI auf einen Blick
5' AG|CT 3' 3' TC|GA 5'
| Erkennungssequenz | 5'-AGCT-3' |
| Schnitt | AG^CT |
| Enden | glatte Enden |
| Erwartete Häufigkeit | etwa einmal alle 256 bp in zufälliger DNA |
So findest du AluI-Schnittstellen in einer Sequenz
- Füge oben eine DNA-Sequenz oder einen FASTA-Eintrag ein. AluI steht schon unter Nur diese Enzyme.
- Setze bei einem Plasmid das Häkchen bei Zirkuläre DNA, damit auch eine Stelle über Ende und Anfang hinweg gefunden wird.
- Die Karte markiert jeden AluI-Schnitt mit seiner Position. Das Ergebnis darunter kannst du kopieren oder herunterladen.
Häufige Fragen
Welche Sequenz schneidet AluI?
AluI erkennt AGCT (von 5' nach 3' geschrieben) und schneidet den oberen Strang bei AG^CT.
Erzeugt AluI klebrige oder glatte Enden?
Glatte Enden ohne Überhang.
Wie oft schneidet AluI?
Eine Sequenz wie AGCT kommt etwa einmal alle 256 bp in zufälliger DNA vor. Echte Sequenzen weichen ab, prüfe deine also oben.
Restriktionsenzyme
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