Toolyard

BssHII-Erkennungssequenz


BssHII auf einen Blick

5' G|CGCGC 3'
3' CGCGC|G 5'
Erkennungssequenz5'-GCGCGC-3'
SchnittG^CGCGC
Endenüberhängende 5'-Enden mit 4 Basen (CGCG)
Erwartete Häufigkeitetwa einmal alle 4.096 bp in zufälliger DNA
Kompatible EndenAscI, MluI

So findest du BssHII-Schnittstellen in einer Sequenz

  1. Füge oben eine DNA-Sequenz oder einen FASTA-Eintrag ein. BssHII steht schon unter Nur diese Enzyme.
  2. Setze bei einem Plasmid das Häkchen bei Zirkuläre DNA, damit auch eine Stelle über Ende und Anfang hinweg gefunden wird.
  3. Die Karte markiert jeden BssHII-Schnitt mit seiner Position. Das Ergebnis darunter kannst du kopieren oder herunterladen.

Häufige Fragen

Welche Sequenz schneidet BssHII?

BssHII erkennt GCGCGC (von 5' nach 3' geschrieben) und schneidet den oberen Strang bei G^CGCGC.

Erzeugt BssHII klebrige oder glatte Enden?

Klebrige Enden: überhängende 5'-Enden mit 4 Basen (CGCG).

Welche Enzyme erzeugen zu BssHII kompatible Enden?

AscI und MluI. Ihre Überhänge sind gleich, daher lassen sich die Enden miteinander ligieren.

Wie oft schneidet BssHII?

Eine Sequenz wie GCGCGC kommt etwa einmal alle 4.096 bp in zufälliger DNA vor. Echte Sequenzen weichen ab, prüfe deine also oben.

Restriktionsenzyme

Weitere DNA- und Proteinsequenz-Tools

Anleitungen