XmaI-Erkennungssequenz

XmaI auf einen Blick

5' C|CCGGG 3'
3' GGGCC|C 5'

So findest du XmaI-Schnittstellen in einer Sequenz

1. Füge oben eine DNA-Sequenz oder einen FASTA-Eintrag ein. XmaI steht schon unter Nur diese Enzyme.
2. Setze bei einem Plasmid das Häkchen bei Zirkuläre DNA, damit auch eine Stelle über Ende und Anfang hinweg gefunden wird.
3. Die Karte markiert jeden XmaI-Schnitt mit seiner Position. Das Ergebnis darunter kannst du kopieren oder herunterladen.

Häufige Fragen

Welche Sequenz schneidet XmaI?

XmaI erkennt CCCGGG (von 5' nach 3' geschrieben) und schneidet den oberen Strang bei C^CCGGG.

Erzeugt XmaI klebrige oder glatte Enden?

Klebrige Enden: überhängende 5'-Enden mit 4 Basen (CCGG).

Welche Enzyme erzeugen zu XmaI kompatible Enden?

AgeI. Ihre Überhänge sind gleich, daher lassen sich die Enden miteinander ligieren.

Wie oft schneidet XmaI?

Eine Sequenz wie CCCGGG kommt etwa einmal alle 4.096 bp in zufälliger DNA vor. Echte Sequenzen weichen ab, prüfe deine also oben.