SacII-Erkennungssequenz
SacII auf einen Blick
5' CCGC|GG 3' 3' GG|CGCC 5'
| Erkennungssequenz | 5'-CCGCGG-3' |
| Schnitt | CCGC^GG |
| Enden | überhängende 3'-Enden mit 2 Basen (GC) |
| Erwartete Häufigkeit | etwa einmal alle 4.096 bp in zufälliger DNA |
So findest du SacII-Schnittstellen in einer Sequenz
- Füge oben eine DNA-Sequenz oder einen FASTA-Eintrag ein. SacII steht schon unter Nur diese Enzyme.
- Setze bei einem Plasmid das Häkchen bei Zirkuläre DNA, damit auch eine Stelle über Ende und Anfang hinweg gefunden wird.
- Die Karte markiert jeden SacII-Schnitt mit seiner Position. Das Ergebnis darunter kannst du kopieren oder herunterladen.
Häufige Fragen
Welche Sequenz schneidet SacII?
SacII erkennt CCGCGG (von 5' nach 3' geschrieben) und schneidet den oberen Strang bei CCGC^GG.
Erzeugt SacII klebrige oder glatte Enden?
Klebrige Enden: überhängende 3'-Enden mit 2 Basen (GC).
Wie oft schneidet SacII?
Eine Sequenz wie CCGCGG kommt etwa einmal alle 4.096 bp in zufälliger DNA vor. Echte Sequenzen weichen ab, prüfe deine also oben.
Restriktionsenzyme
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