AvaI-Erkennungssequenz
AvaI auf einen Blick
5' C|YCGRG 3' 3' GRGCY|C 5'
| Erkennungssequenz | 5'-CYCGRG-3' |
| Schnitt | C^YCGRG |
| Enden | überhängende 5'-Enden mit 4 Basen (YCGR) |
| Erwartete Häufigkeit | etwa einmal alle 1.024 bp in zufälliger DNA |
So findest du AvaI-Schnittstellen in einer Sequenz
- Füge oben eine DNA-Sequenz oder einen FASTA-Eintrag ein. AvaI steht schon unter Nur diese Enzyme.
- Setze bei einem Plasmid das Häkchen bei Zirkuläre DNA, damit auch eine Stelle über Ende und Anfang hinweg gefunden wird.
- Die Karte markiert jeden AvaI-Schnitt mit seiner Position. Das Ergebnis darunter kannst du kopieren oder herunterladen.
Häufige Fragen
Welche Sequenz schneidet AvaI?
AvaI erkennt CYCGRG (von 5' nach 3' geschrieben) und schneidet den oberen Strang bei C^YCGRG.
Erzeugt AvaI klebrige oder glatte Enden?
Klebrige Enden: überhängende 5'-Enden mit 4 Basen (YCGR).
Wie oft schneidet AvaI?
Eine Sequenz wie CYCGRG kommt etwa einmal alle 1.024 bp in zufälliger DNA vor. Echte Sequenzen weichen ab, prüfe deine also oben.
Restriktionsenzyme
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