ClaI-Erkennungssequenz

ClaI auf einen Blick

5' AT|CGAT 3'
3' TAGC|TA 5'

So findest du ClaI-Schnittstellen in einer Sequenz

1. Füge oben eine DNA-Sequenz oder einen FASTA-Eintrag ein. ClaI steht schon unter Nur diese Enzyme.
2. Setze bei einem Plasmid das Häkchen bei Zirkuläre DNA, damit auch eine Stelle über Ende und Anfang hinweg gefunden wird.
3. Die Karte markiert jeden ClaI-Schnitt mit seiner Position. Das Ergebnis darunter kannst du kopieren oder herunterladen.

Häufige Fragen

Welche Sequenz schneidet ClaI?

ClaI erkennt ATCGAT (von 5' nach 3' geschrieben) und schneidet den oberen Strang bei AT^CGAT.

Erzeugt ClaI klebrige oder glatte Enden?

Klebrige Enden: überhängende 5'-Enden mit 2 Basen (CG).

Welche Enzyme erzeugen zu ClaI kompatible Enden?

BstBI, MspI und TaqI. Ihre Überhänge sind gleich, daher lassen sich die Enden miteinander ligieren.

Wie oft schneidet ClaI?

Eine Sequenz wie ATCGAT kommt etwa einmal alle 4.096 bp in zufälliger DNA vor. Echte Sequenzen weichen ab, prüfe deine also oben.