XhoI-Erkennungssequenz
XhoI auf einen Blick
5' C|TCGAG 3' 3' GAGCT|C 5'
| Erkennungssequenz | 5'-CTCGAG-3' |
| Schnitt | C^TCGAG |
| Enden | überhängende 5'-Enden mit 4 Basen (TCGA) |
| Erwartete Häufigkeit | etwa einmal alle 4.096 bp in zufälliger DNA |
| Kompatible Enden | SalI |
So findest du XhoI-Schnittstellen in einer Sequenz
- Füge oben eine DNA-Sequenz oder einen FASTA-Eintrag ein. XhoI steht schon unter Nur diese Enzyme.
- Setze bei einem Plasmid das Häkchen bei Zirkuläre DNA, damit auch eine Stelle über Ende und Anfang hinweg gefunden wird.
- Die Karte markiert jeden XhoI-Schnitt mit seiner Position. Das Ergebnis darunter kannst du kopieren oder herunterladen.
Häufige Fragen
Welche Sequenz schneidet XhoI?
XhoI erkennt CTCGAG (von 5' nach 3' geschrieben) und schneidet den oberen Strang bei C^TCGAG.
Erzeugt XhoI klebrige oder glatte Enden?
Klebrige Enden: überhängende 5'-Enden mit 4 Basen (TCGA).
Welche Enzyme erzeugen zu XhoI kompatible Enden?
SalI. Ihre Überhänge sind gleich, daher lassen sich die Enden miteinander ligieren.
Wie oft schneidet XhoI?
Eine Sequenz wie CTCGAG kommt etwa einmal alle 4.096 bp in zufälliger DNA vor. Echte Sequenzen weichen ab, prüfe deine also oben.
Restriktionsenzyme
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