Toolyard

Situs Pengenalan XhoI


Ringkasan XhoI

5' C|TCGAG 3'
3' GAGCT|C 5'
Situs pengenalan5'-CTCGAG-3'
PotonganC^TCGAG
Ujungujung 5' menggantung sepanjang 4 basa (TCGA)
Frekuensi perkiraansekitar sekali setiap 4.096 bp pada DNA acak
Ujung yang kompatibelSalI

Cara menemukan situs XhoI dalam sekuens

  1. Tempel sekuens DNA atau rekaman FASTA di kotak di atas. XhoI sudah terisi di Hanya enzim ini.
  2. Centang DNA sirkular untuk plasmid, agar situs yang melintasi ujung dan awal sekuens juga ditemukan.
  3. Peta menandai setiap potongan XhoI beserta posisinya. Salin atau unduh hasil di bawahnya.

Pertanyaan umum

Sekuens apa yang dipotong XhoI?

XhoI mengenali CTCGAG (ditulis dari 5' ke 3') dan memotong untai atas di C^TCGAG.

Apakah XhoI menghasilkan ujung lengket atau tumpul?

Ujung lengket: ujung 5' menggantung sepanjang 4 basa (TCGA).

Enzim apa yang menghasilkan ujung yang kompatibel dengan XhoI?

SalI. Bagian menggantungnya sama, jadi ujung-ujungnya bisa diligasi satu sama lain.

Seberapa sering XhoI memotong?

Situs seperti CTCGAG muncul sekitar sekali setiap 4.096 bp pada DNA acak. Sekuens nyata bervariasi, jadi periksa sekuens Anda di atas.

Enzim restriksi

Alat sekuens DNA dan protein lainnya

Panduan