Toolyard

Situs Pengenalan SfiI


Ringkasan SfiI

5' GGCCNNNN|NGGCC 3'
3' CCGGN|NNNNCCGG 5'
Situs pengenalan5'-GGCCNNNNNGGCC-3'
PotonganGGCCNNNN^NGGCC
Ujungujung 3' menggantung sepanjang 3 basa (NNN)
Frekuensi perkiraansekitar sekali setiap 65.536 bp pada DNA acak

Cara menemukan situs SfiI dalam sekuens

  1. Tempel sekuens DNA atau rekaman FASTA di kotak di atas. SfiI sudah terisi di Hanya enzim ini.
  2. Centang DNA sirkular untuk plasmid, agar situs yang melintasi ujung dan awal sekuens juga ditemukan.
  3. Peta menandai setiap potongan SfiI beserta posisinya. Salin atau unduh hasil di bawahnya.

Pertanyaan umum

Sekuens apa yang dipotong SfiI?

SfiI mengenali GGCCNNNNNGGCC (ditulis dari 5' ke 3') dan memotong untai atas di GGCCNNNN^NGGCC.

Apakah SfiI menghasilkan ujung lengket atau tumpul?

Ujung lengket: ujung 3' menggantung sepanjang 3 basa (NNN).

Seberapa sering SfiI memotong?

Situs seperti GGCCNNNNNGGCC muncul sekitar sekali setiap 65.536 bp pada DNA acak. Sekuens nyata bervariasi, jadi periksa sekuens Anda di atas.

Enzim restriksi

Alat sekuens DNA dan protein lainnya

Panduan