Toolyard

Situs Pengenalan MspI


Ringkasan MspI

5' C|CGG 3'
3' GGC|C 5'
Situs pengenalan5'-CCGG-3'
PotonganC^CGG
Ujungujung 5' menggantung sepanjang 2 basa (CG)
Frekuensi perkiraansekitar sekali setiap 256 bp pada DNA acak
Ujung yang kompatibelBstBI, ClaI, TaqI

Cara menemukan situs MspI dalam sekuens

  1. Tempel sekuens DNA atau rekaman FASTA di kotak di atas. MspI sudah terisi di Hanya enzim ini.
  2. Centang DNA sirkular untuk plasmid, agar situs yang melintasi ujung dan awal sekuens juga ditemukan.
  3. Peta menandai setiap potongan MspI beserta posisinya. Salin atau unduh hasil di bawahnya.

Pertanyaan umum

Sekuens apa yang dipotong MspI?

MspI mengenali CCGG (ditulis dari 5' ke 3') dan memotong untai atas di C^CGG.

Apakah MspI menghasilkan ujung lengket atau tumpul?

Ujung lengket: ujung 5' menggantung sepanjang 2 basa (CG).

Enzim apa yang menghasilkan ujung yang kompatibel dengan MspI?

BstBI, ClaI, dan TaqI. Bagian menggantungnya sama, jadi ujung-ujungnya bisa diligasi satu sama lain.

Seberapa sering MspI memotong?

Situs seperti CCGG muncul sekitar sekali setiap 256 bp pada DNA acak. Sekuens nyata bervariasi, jadi periksa sekuens Anda di atas.

Enzim restriksi

Alat sekuens DNA dan protein lainnya

Panduan