Ekstraktor Fitur GenBank
Cara mengekstrak fitur dari file GenBank
- Tempel satu atau beberapa rekaman GenBank beserta tabel FEATURES dan sekuensnya.
- Ketik jenis fitur yang ingin diambil, misalnya CDS gene rRNA, atau centang Semua jenis fitur.
- Setiap fitur menjadi rekaman FASTA dengan jenis, nama, dan lokasinya di judul.
Pertanyaan umum
Apakah join dan complement ditangani?
Ya. Potongan join() digabung sesuai urutan dan fitur complement() dibuat komplemen baliknya, sehingga CDS keluar terbaca dari 5' ke 3' mulai dari kodon start-nya.
Bisakah CDS-nya juga ditranslasi?
Gunakan Ekstraktor Translasi GenBank untuk mendapatkan translasi protein yang tersimpan pada tiap CDS.
Apakah sekuens saya diunggah?
Tidak. Semuanya berjalan di browser Anda, jadi sekuens Anda tidak pernah meninggalkan perangkat.
Alat sekuens DNA dan protein lainnya
Komplemen BalikDNA ke RNAGabungkan Sekuens FASTAPecah Sekuens FASTAGenBank ke FASTAEMBL ke FASTAEkstraktor Fitur EMBLEkstraktor Translasi GenBankEkstraktor Translasi EMBLPecah Menjadi KodonEkstraktor Rentang DNAEkstraktor Rentang ProteinEkstraktor Jendela DNAEkstraktor Jendela ProteinBersihkan DNABersihkan ProteinKelompokkan DNAKelompokkan ProteinAsam Amino Satu ke Tiga HurufAsam Amino Tiga ke Satu HurufStatistik DNAStatistik ProteinPenggunaan KodonPencari Pulau CpGBerat Molekul DNABerat Molekul ProteinTitik Isoelektrik ProteinGRAVY ProteinCari Pola DNACari Pola ProteinPencarian Mirip DNAPencarian Mirip ProteinIdentitas dan KemiripanPencari ORFTranslasi DNA ke ProteinTranslasi BalikTranslasi Balik Penyejajaran ProteinStatistik Primer PCRProduk PCRRingkasan RestriksiMutasi untuk DigestiSejajarkan Dua DNASejajarkan Dua ProteinSejajarkan KodonPeta RestriksiPeta TranslasiPeta PrimerWarnai Penyejajaran Menurut KonservasiWarnai Penyejajaran Menurut SifatPlot KodonSekuens DNA AcakSekuens Protein AcakDNA Penyandi AcakWilayah DNA AcakWilayah Protein AcakSampel DNASampel ProteinAcak Urutan DNAAcak Urutan ProteinMutasikan DNAMutasikan ProteinKode GenetikKode IUPAC