GenBank・EMBL フィーチャー抽出

GenBank・EMBL ファイルからフィーチャーを取り出す方法

1. フィーチャーと配列を含む GenBank または EMBL のレコードを1件以上貼り付けます。
2. 取り出すフィーチャー型を CDS gene rRNA のように入力するか、すべてのフィーチャー型にチェックを入れます。
3. 各フィーチャーは、型、名前、位置をタイトルにした FASTA レコードになります。

よくある質問

join や complement は扱えますか？

はい。join() の各部分は順番につながれ、complement() のフィーチャーは逆相補鎖になるため、CDS は開始コドンから 5' → 3' の向きで出力されます。

CDS の翻訳も取り出せますか？

GenBank 翻訳抽出を使うと、各 CDS に保存されたタンパク質翻訳を取り出せます。

配列はアップロードされますか？

いいえ。すべてブラウザの中で動くため、配列が端末の外に出ることはありません。