Toolyard

GenBank- und EMBL-Feature-Extraktor

So extrahierst du Features aus einer GenBank- oder EMBL-Datei

  1. Füge einen oder mehrere GenBank- oder EMBL-Einträge mit ihren Features und ihrer Sequenz ein.
  2. Gib die gewünschten Feature-Typen ein, etwa CDS gene rRNA, oder setze das Häkchen bei Alle Feature-Typen.
  3. Jedes Feature wird ein FASTA-Eintrag mit Typ, Name und Position im Titel.

Häufige Fragen

Werden join und complement berücksichtigt?

Ja. Teile von join() werden der Reihe nach verbunden und complement()-Features revers komplementiert, sodass eine CDS von 5' nach 3' ab ihrem Startcodon ausgegeben wird.

Kann ich die CDS auch übersetzen?

Der GenBank-Translation-Extraktor liefert die Proteinübersetzung, die bei jeder CDS gespeichert ist.

Wird meine Sequenz hochgeladen?

Nein. Alles läuft in deinem Browser, deine Sequenzen verlassen dein Gerät also nicht.

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