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Extracteur de features GenBank et EMBL

Comment extraire les features d’un fichier GenBank ou EMBL

  1. Collez une ou plusieurs entrées GenBank ou EMBL avec leurs features et leur séquence.
  2. Saisissez les types de feature à extraire, comme CDS gene rRNA, ou cochez Tous les types de feature.
  3. Chaque feature devient une entrée FASTA avec son type, son nom et sa position dans le titre.

Questions fréquentes

join et complement sont-ils pris en compte ?

Oui. Les morceaux de join() sont réunis dans l’ordre et les features complement() passent par leur complément inverse, si bien qu’une CDS sort lue de 5' vers 3' depuis son codon d’initiation.

Peut-il aussi traduire la CDS ?

Utilisez l’Extracteur de traductions GenBank pour obtenir la traduction protéique enregistrée avec chaque CDS.

Ma séquence est-elle envoyée ?

Non. Tout fonctionne dans votre navigateur : vos séquences ne quittent jamais votre appareil.

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