Fenêtres glissantes

Comment extraire des fenêtres glissantes d’une séquence

1. Choisissez ADN ou protéine dans Type de séquence, puis collez la séquence, en texte brut ou en FASTA.
2. Réglez la taille de fenêtre et le pas entre le début d’une fenêtre et la suivante.
3. Chaque fenêtre devient une entrée FASTA avec sa position dans le titre.

Questions fréquentes

Quel pas choisir ?

Un pas égal à la taille de fenêtre donne des fenêtres contiguës sans chevauchement. Un pas plus petit les fait se chevaucher ; un pas de 1 donne toutes les fenêtres possibles.

Comment créer des peptides chevauchants ?

Réglez la fenêtre sur la longueur du peptide et le pas sur le décalage entre peptides, par exemple 15 et 5 pour des 15-mères qui se chevauchent de 10.

Ma séquence est-elle envoyée ?

Non. Tout fonctionne dans votre navigateur : vos séquences ne quittent jamais votre appareil.