Скользящее окно

Как извлечь скользящие окна из последовательности

1. Выберите ДНК или белок в поле «Тип последовательности» и вставьте последовательность, обычным текстом или в FASTA.
2. Задайте размер окна и шаг между началом одного окна и следующего.
3. Каждое окно становится записью FASTA с его положением в заголовке.

Частые вопросы

Какой шаг выбрать?

Шаг, равный размеру окна, даёт окна, которые соприкасаются без перекрытия. Меньший шаг даёт перекрытие; шаг 1 даёт все возможные окна.

Как сделать перекрывающиеся пептиды?

Задайте окно равным длине пептида, а шаг — сдвигу каждого следующего пептида, например 15 и 5 для 15-меров с перекрытием 10.

Мои последовательности загружаются на сервер?

Нет. Всё работает в браузере, поэтому последовательности не покидают устройство.