Fenster extrahieren

So extrahierst du gleitende Fenster aus einer Sequenz

1. Wähle unter Sequenztyp DNA oder Protein und füge die Sequenz ein, als Text oder FASTA.
2. Lege die Fenstergröße und die Schrittweite zwischen dem Anfang eines Fensters und dem nächsten fest.
3. Jedes Fenster wird ein FASTA-Eintrag mit seiner Position im Titel.

Häufige Fragen

Welche Schrittweite soll ich nehmen?

Eine Schrittweite gleich der Fenstergröße ergibt aneinanderliegende Fenster ohne Überlappung. Eine kleinere lässt sie überlappen; eine Schrittweite von 1 ergibt jedes mögliche Fenster.

Wie erstelle ich überlappende Peptide?

Setze das Fenster auf die Peptidlänge und die Schrittweite darauf, wie weit jedes Peptid weiterrückt, zum Beispiel 15 und 5 für 15-mere, die sich um 10 überlappen.

Wird meine Sequenz hochgeladen?

Nein. Alles läuft in deinem Browser, deine Sequenzen verlassen dein Gerät also nicht.