Toolyard

Ekstraktor Jendela

Cara mengekstrak jendela geser dari sekuens

  1. Pilih DNA atau protein di Jenis sekuens, lalu tempel sekuensnya, sebagai teks biasa atau FASTA.
  2. Atur ukuran jendela dan langkah antara awal satu jendela dan jendela berikutnya.
  3. Setiap jendela menjadi rekaman FASTA dengan posisinya di judul.

Pertanyaan umum

Langkah berapa yang sebaiknya dipakai?

Langkah sama dengan ukuran jendela menghasilkan jendela yang bersambung tanpa tumpang tindih. Langkah lebih kecil membuatnya tumpang tindih; langkah 1 menghasilkan semua jendela yang mungkin.

Bagaimana membuat peptida yang tumpang tindih?

Atur jendela sesuai panjang peptida dan langkah sesuai pergeseran tiap peptida, misalnya 15 dan 5 untuk peptida 15-mer yang tumpang tindih 10.

Apakah sekuens saya diunggah?

Tidak. Semuanya berjalan di browser Anda, jadi sekuens Anda tidak pernah meninggalkan perangkat.

Sematkan alat ini di situs Anda

Alat sekuens DNA dan protein lainnya

Ekstraktor Fitur GenBank dan EMBLEkstraktor Translasi GenBank dan EMBLPecah Menjadi KodonEkstraktor RentangBersihkan SekuensKelompokkan SekuensKonverter Kode Asam AminoStatistik DNAAlat sekuens DNA dan protein lainnya (50)