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ウィンドウ抽出

配列からスライディングウィンドウを取り出す方法

  1. 配列の種類で DNA かタンパク質を選び、配列をテキストまたは FASTA で貼り付けます。
  2. ウィンドウの大きさと、次のウィンドウの開始までのステップを設定します。
  3. 各ウィンドウは、位置をタイトルに持つ FASTA レコードになります。

よくある質問

ステップはいくつにすればよいですか?

ウィンドウの大きさと同じステップなら、重ならずに隙間なく並びます。小さくすると重なり、1 にすると取りうるすべてのウィンドウが出力されます。

重なり合うペプチドを作るには?

ウィンドウをペプチドの長さに、ステップをずらす幅にします。たとえば 10 残基ずつ重なる 15 残基のペプチドなら 15 と 5 です。

配列はアップロードされますか?

いいえ。すべてブラウザの中で動くため、配列が端末の外に出ることはありません。

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