ウィンドウ抽出
配列からスライディングウィンドウを取り出す方法
- 配列の種類で DNA かタンパク質を選び、配列をテキストまたは FASTA で貼り付けます。
- ウィンドウの大きさと、次のウィンドウの開始までのステップを設定します。
- 各ウィンドウは、位置をタイトルに持つ FASTA レコードになります。
よくある質問
ステップはいくつにすればよいですか?
ウィンドウの大きさと同じステップなら、重ならずに隙間なく並びます。小さくすると重なり、1 にすると取りうるすべてのウィンドウが出力されます。
重なり合うペプチドを作るには?
ウィンドウをペプチドの長さに、ステップをずらす幅にします。たとえば 10 残基ずつ重なる 15 残基のペプチドなら 15 と 5 です。
配列はアップロードされますか?
いいえ。すべてブラウザの中で動くため、配列が端末の外に出ることはありません。