مستخرج ميزات GenBank
كيف تستخرج الميزات من ملف GenBank
- الصق سجل GenBank واحدًا أو أكثر مع جدول FEATURES وتسلسله.
- اكتب أنواع الميزات التي تريد استخراجها، مثل CDS gene rRNA، أو فعّل «كل أنواع الميزات».
- كل ميزة سجل FASTA مع نوعها واسمها وموقعها في العنوان.
الأسئلة الشائعة
هل يُؤخذ join وcomplement في الحسبان؟
نعم. تُجمع أجزاء join() بالترتيب وتُحوَّل ميزات complement() إلى متممها العكسي، فتخرج CDS مقروءة من '5 إلى '3 من كودون البدء.
هل يمكنه ترجمة CDS أيضًا؟
استخدم مستخرج ترجمات GenBank للحصول على ترجمة البروتين المحفوظة مع كل CDS.
هل يُرفع تسلسلي؟
لا. كل شيء يعمل في متصفحك، فلا تغادر تسلسلاتك جهازك أبدًا.
مزيد من أدوات تسلسلات الحمض النووي والبروتين
المتمم العكسيDNA إلى RNAدمج تسلسلات FASTAتقسيم تسلسل FASTAGenBank إلى FASTAEMBL إلى FASTAمستخرج ميزات EMBLمستخرج ترجمات GenBankمستخرج ترجمات EMBLالتقسيم إلى كودوناتمستخرج نطاقات DNAمستخرج نطاقات البروتينمستخرج نوافذ DNAمستخرج نوافذ البروتينتنظيف DNAتنظيف البروتينتجميع DNAتجميع البروتينالأحماض الأمينية من حرف إلى ثلاثة أحرفالأحماض الأمينية من ثلاثة أحرف إلى حرفإحصاءات DNAإحصاءات البروتيناستخدام الكودوناتباحث جزر CpGالوزن الجزيئي لـ DNAالوزن الجزيئي للبروتيننقطة التعادل الكهربائي للبروتينGRAVY للبروتينالبحث عن نمط في DNAالبحث عن نمط في البروتينبحث تقريبي في DNAبحث تقريبي في البروتينالتطابق والتشابهباحث ORFترجمة DNA إلى بروتينالترجمة العكسيةالترجمة العكسية لمحاذاة بروتيناتتحليل بادئات PCRنواتج PCRملخص التقييدالطفر من أجل الهضممحاذاة تسلسلي DNAمحاذاة بروتينينمحاذاة الكودوناتتحسين الكودوناتباحث أدلة CRISPRخريطة التقييدخريطة الترجمةخريطة البادئاتتلوين المحاذاة حسب الحفظتلوين المحاذاة حسب الخصائصمخطط الكودوناتعارض خرائط البلازميداتتسلسل DNA عشوائيتسلسل بروتين عشوائيDNA مشفِّر عشوائيمناطق DNA عشوائيةمناطق بروتين عشوائيةعيّنات DNAعيّنات البروتينخلط DNAخلط البروتينطفر DNAطفر البروتينالشفرات الوراثيةرموز IUPAC