محاذاة تسلسلي DNA
كيف تحاذي تسلسلي DNA
- الصق تسلسلي DNA.
- حدد نقاط التطابق وعدم التطابق وعقوبتي فتح الفجوة وتمديدها، وفعّل خيار الفجوات الطرفية إن كان أحد التسلسلين داخل الآخر.
- انقر «حاذِ» لترى المحاذاة مع التطابق والفجوات والنتيجة.
الأسئلة الشائعة
ما الطريقة المستخدمة؟
محاذاة شاملة (Needleman-Wunsch) بعقوبات فجوات تآلفية، فالفجوة الطويلة تكلف أقل من فجوات قصيرة كثيرة.
ما الطول المسموح للتسلسلات؟
نحو 5000 في 5000 حرف، لأن المحاذاة كلها تجري في متصفحك.
هل يُرفع تسلسلي؟
لا. كل شيء يعمل في متصفحك، فلا تغادر تسلسلاتك جهازك أبدًا.
مزيد من أدوات تسلسلات الحمض النووي والبروتين
المتمم العكسيDNA إلى RNAدمج تسلسلات FASTAتقسيم تسلسل FASTAGenBank إلى FASTAEMBL إلى FASTAمستخرج ميزات GenBankمستخرج ميزات EMBLمستخرج ترجمات GenBankمستخرج ترجمات EMBLالتقسيم إلى كودوناتمستخرج نطاقات DNAمستخرج نطاقات البروتينمستخرج نوافذ DNAمستخرج نوافذ البروتينتنظيف DNAتنظيف البروتينتجميع DNAتجميع البروتينالأحماض الأمينية من حرف إلى ثلاثة أحرفالأحماض الأمينية من ثلاثة أحرف إلى حرفإحصاءات DNAإحصاءات البروتيناستخدام الكودوناتباحث جزر CpGالوزن الجزيئي لـ DNAالوزن الجزيئي للبروتيننقطة التعادل الكهربائي للبروتينGRAVY للبروتينالبحث عن نمط في DNAالبحث عن نمط في البروتينبحث تقريبي في DNAبحث تقريبي في البروتينالتطابق والتشابهباحث ORFترجمة DNA إلى بروتينالترجمة العكسيةالترجمة العكسية لمحاذاة بروتيناتتحليل بادئات PCRنواتج PCRملخص التقييدالطفر من أجل الهضممحاذاة بروتينينمحاذاة الكودوناتتحسين الكودوناتباحث أدلة CRISPRخريطة التقييدخريطة الترجمةخريطة البادئاتتلوين المحاذاة حسب الحفظتلوين المحاذاة حسب الخصائصمخطط الكودوناتعارض خرائط البلازميداتتسلسل DNA عشوائيتسلسل بروتين عشوائيDNA مشفِّر عشوائيمناطق DNA عشوائيةمناطق بروتين عشوائيةعيّنات DNAعيّنات البروتينخلط DNAخلط البروتينطفر DNAطفر البروتينالشفرات الوراثيةرموز IUPAC