Sejajarkan Dua DNA
Cara menyejajarkan dua sekuens DNA
- Tempel kedua sekuens DNA.
- Atur skor kecocokan dan ketidakcocokan serta penalti pembukaan dan perpanjangan celah, dan centang Celah ujung tanpa penalti jika satu sekuens berada di dalam sekuens lainnya.
- Klik Sejajarkan untuk melihat penyejajaran dengan identitas, celah, dan skor.
Pertanyaan umum
Metode apa yang dipakai?
Penyejajaran global (Needleman-Wunsch) dengan penalti celah afin, sehingga satu celah panjang lebih murah daripada banyak celah pendek.
Seberapa panjang sekuensnya boleh?
Sekitar 5.000 kali 5.000 huruf, karena seluruh penyejajaran berjalan di browser Anda.
Apakah sekuens saya diunggah?
Tidak. Semuanya berjalan di browser Anda, jadi sekuens Anda tidak pernah meninggalkan perangkat.
Alat sekuens DNA dan protein lainnya
Komplemen BalikDNA ke RNAGabungkan Sekuens FASTAPecah Sekuens FASTAGenBank ke FASTAEMBL ke FASTAEkstraktor Fitur GenBankEkstraktor Fitur EMBLEkstraktor Translasi GenBankEkstraktor Translasi EMBLPecah Menjadi KodonEkstraktor Rentang DNAEkstraktor Rentang ProteinEkstraktor Jendela DNAEkstraktor Jendela ProteinBersihkan DNABersihkan ProteinKelompokkan DNAKelompokkan ProteinAsam Amino Satu ke Tiga HurufAsam Amino Tiga ke Satu HurufStatistik DNAStatistik ProteinPenggunaan KodonPencari Pulau CpGBerat Molekul DNABerat Molekul ProteinTitik Isoelektrik ProteinGRAVY ProteinCari Pola DNACari Pola ProteinPencarian Mirip DNAPencarian Mirip ProteinIdentitas dan KemiripanPencari ORFTranslasi DNA ke ProteinTranslasi BalikTranslasi Balik Penyejajaran ProteinStatistik Primer PCRProduk PCRRingkasan RestriksiMutasi untuk DigestiSejajarkan Dua ProteinSejajarkan KodonPeta RestriksiPeta TranslasiPeta PrimerWarnai Penyejajaran Menurut KonservasiWarnai Penyejajaran Menurut SifatPlot KodonSekuens DNA AcakSekuens Protein AcakDNA Penyandi AcakWilayah DNA AcakWilayah Protein AcakSampel DNASampel ProteinAcak Urutan DNAAcak Urutan ProteinMutasikan DNAMutasikan ProteinKode GenetikKode IUPAC