Statistik Primer PCR

Cara memeriksa primer PCR

1. Tempel primer satu per baris, dengan nama opsional sebelum tiap sekuens, atau sebagai FASTA.
2. Atur konsentrasi primer dan natrium yang dipakai untuk suhu leleh nearest neighbor.
3. Setiap primer dicantumkan dengan panjang, kandungan GC, tiga suhu leleh, berat molekul, dan peringatan jika ada.

Pertanyaan umum

Suhu leleh mana yang sebaiknya dipakai?

Nilai nearest neighbor paling akurat. Rumus dasar menghitung 2 °C per A atau T dan 4 °C per G atau C untuk primer pendek, dengan rumus GC untuk yang lebih panjang; nilai yang disesuaikan garam mengoreksinya untuk natrium.

Apa saja yang diperiksa peringatannya?

Panjang di luar 18-30 basa, kandungan GC di luar 40-60%, tidak ada G atau C di ujung 3', lebih dari 3 G atau C di 5 basa terakhir, deretan 5 basa yang sama atau lebih, dan bagian komplementer-diri yang bisa membentuk jepit rambut atau dimer primer.

Apakah sekuens saya diunggah?

Tidak. Semuanya berjalan di browser Anda, jadi sekuens Anda tidak pernah meninggalkan perangkat.