Sejajarkan Dua Sekuens

Cara menyejajarkan dua sekuens DNA atau protein

1. Pilih DNA atau protein, lalu tempel kedua sekuens.
2. Atur penalti pembukaan dan perpanjangan gap, dan untuk DNA skor cocok dan tidak cocok. Centang Gap ujung bebas jika satu sekuens berada di dalam yang lain.
3. Klik Sejajarkan untuk melihat penyejajaran beserta identitas, gap, dan skor, dan untuk protein juga kemiripannya.

Pertanyaan umum

Metode apa yang dipakai?

Penyejajaran global (Needleman-Wunsch) dengan penalti celah afin, sehingga satu celah panjang lebih murah daripada banyak celah pendek.

Matriks skor apa yang dipakai?

BLOSUM62, dengan penyejajaran global (Needleman-Wunsch) dan penalti celah afin.

Apa arti simbol di antara baris?

Garis tegak menandai residu identik dan titik dua menandai residu yang mirip.

Seberapa panjang sekuensnya boleh?

Sekitar 5.000 kali 5.000 huruf, karena seluruh penyejajaran berjalan di browser Anda.

Apakah sekuens saya diunggah?

Tidak. Semuanya berjalan di browser Anda, jadi sekuens Anda tidak pernah meninggalkan perangkat.