쌍 정렬
두 DNA·단백질 서열을 정렬하는 방법
- DNA나 단백질을 고르고 두 서열을 붙여 넣으세요.
- 갭 시작과 연장 벌점을 정하고, DNA라면 일치와 불일치 점수도 정하세요. 한 서열이 다른 서열 안에 들어 있으면 끝 갭 무료에 체크하세요.
- 정렬을 누르면 일치도, 갭, 점수와 함께, 단백질은 유사도까지 정렬이 나옵니다.
자주 묻는 질문
어떤 방법을 쓰나요?
아핀 갭 벌점을 쓰는 전역 정렬(Needleman-Wunsch)입니다. 긴 갭 하나가 짧은 갭 여러 개보다 비용이 적습니다.
어떤 점수 행렬을 쓰나요?
BLOSUM62를 쓰고, 아핀 갭 벌점으로 전역 정렬(Needleman-Wunsch)을 합니다.
줄 사이의 기호는 무엇인가요?
세로 막대는 같은 잔기, 콜론은 비슷한 잔기를 뜻합니다.
서열은 얼마나 길어도 되나요?
정렬 전체를 브라우저 안에서 계산하므로 약 5,000 × 5,000글자까지입니다.
서열이 업로드되나요?
아니요. 모든 작업이 브라우저 안에서 이루어지므로 서열이 기기 밖으로 나가지 않습니다.