Alinear dos secuencias
Cómo alinear dos secuencias de ADN o proteína
- Elige ADN o proteína y pega las dos secuencias.
- Fija las penalizaciones de apertura y extensión de hueco y, para ADN, las puntuaciones de coincidencia y discrepancia. Marca Huecos libres en los extremos si una secuencia está dentro de la otra.
- Haz clic en Alinear para ver el alineamiento con la identidad, los huecos y la puntuación y, en proteínas, la similitud.
Preguntas frecuentes
¿Qué método usa?
Un alineamiento global (Needleman-Wunsch) con penalizaciones de gap afines, así que un gap largo cuesta menos que muchos cortos.
¿Qué matriz de puntuación usa?
BLOSUM62, con un alineamiento global (Needleman-Wunsch) y penalizaciones de gap afines.
¿Qué significan los símbolos entre las líneas?
Una barra vertical marca residuos idénticos y dos puntos, residuos similares.
¿Qué longitud pueden tener las secuencias?
Unas 5000 por 5000 letras, porque todo el alineamiento se hace en tu navegador.
¿Se sube mi secuencia?
No. Todo funciona en tu navegador, así que tus secuencias nunca salen de tu dispositivo.
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