Sejajarkan Kodon
Cara menyejajarkan dua sekuens penyandi per kodon
- Tempel kedua sekuens DNA penyandi, sesuai rangka.
- Pilih kode genetik dan penalti celah.
- Klik Sejajarkan. Protein disejajarkan dan celahnya disalin kembali ke DNA, sehingga kodon tetap utuh.
Pertanyaan umum
Mengapa menyejajarkan kodon, bukan basa?
Penyejajaran basa bisa menaruh celah di tengah kodon. Menyejajarkan protein lebih dulu menjaga setiap kodon tetap utuh, yang dibutuhkan dN/dS dan analisis berbasis kodon lainnya.
Apakah sekuens saya diunggah?
Tidak. Semuanya berjalan di browser Anda, jadi sekuens Anda tidak pernah meninggalkan perangkat.
Alat sekuens DNA dan protein lainnya
Komplemen BalikDNA ke RNAGabungkan Sekuens FASTAPecah Sekuens FASTAGenBank ke FASTAEMBL ke FASTAEkstraktor Fitur GenBankEkstraktor Fitur EMBLEkstraktor Translasi GenBankEkstraktor Translasi EMBLPecah Menjadi KodonEkstraktor Rentang DNAEkstraktor Rentang ProteinEkstraktor Jendela DNAEkstraktor Jendela ProteinBersihkan DNABersihkan ProteinKelompokkan DNAKelompokkan ProteinAsam Amino Satu ke Tiga HurufAsam Amino Tiga ke Satu HurufStatistik DNAStatistik ProteinPenggunaan KodonPencari Pulau CpGBerat Molekul DNABerat Molekul ProteinTitik Isoelektrik ProteinGRAVY ProteinCari Pola DNACari Pola ProteinPencarian Mirip DNAPencarian Mirip ProteinIdentitas dan KemiripanPencari ORFTranslasi DNA ke ProteinTranslasi BalikTranslasi Balik Penyejajaran ProteinStatistik Primer PCRProduk PCRRingkasan RestriksiMutasi untuk DigestiSejajarkan Dua DNASejajarkan Dua ProteinPeta RestriksiPeta TranslasiPeta PrimerWarnai Penyejajaran Menurut KonservasiWarnai Penyejajaran Menurut SifatPlot KodonSekuens DNA AcakSekuens Protein AcakDNA Penyandi AcakWilayah DNA AcakWilayah Protein AcakSampel DNASampel ProteinAcak Urutan DNAAcak Urutan ProteinMutasikan DNAMutasikan ProteinKode GenetikKode IUPAC