Alinhar códons
Como alinhar duas sequências codificantes por códon
- Cole as duas sequências de DNA codificante, em quadro.
- Escolha o código genético e as penalidades de gap.
- Clique em Alinhar. As proteínas são alinhadas e os gaps copiados de volta para o DNA, então os códons ficam inteiros.
Perguntas frequentes
Por que alinhar códons em vez de bases?
Um alinhamento de bases pode pôr gaps no meio de códons. Alinhar as proteínas primeiro mantém cada códon inteiro, que é o que dN/dS e outras análises por códon precisam.
Minha sequência é enviada?
Não. Tudo roda no seu navegador, então suas sequências nunca saem do seu dispositivo.
Mais ferramentas de sequências de DNA e proteína
Complemento reversoDNA para RNACombinar sequências FASTADividir sequência FASTAGenBank para FASTAEMBL para FASTAExtrator de features GenBankExtrator de features EMBLExtrator de traduções GenBankExtrator de traduções EMBLDividir em códonsExtrator de intervalos de DNAExtrator de intervalos de proteínaExtrator de janelas de DNAExtrator de janelas de proteínaLimpar DNALimpar proteínaAgrupar DNAAgrupar proteínaAminoácidos de uma para três letrasAminoácidos de três para uma letraEstatísticas de DNAEstatísticas de proteínaUso de códonsLocalizador de ilhas CpGPeso molecular de DNAPeso molecular de proteínaPonto isoelétrico de proteínaGRAVY de proteínaBuscar padrão em DNABuscar padrão em proteínaBusca aproximada em DNABusca aproximada em proteínaIdentidade e similaridadeLocalizador de ORFTraduzir DNA em proteínaTradução reversaTradução reversa de um alinhamento de proteínasAnálise de primers de PCRProdutos de PCRResumo de restriçãoMutar para digestãoAlinhar dois DNAAlinhar duas proteínasMapa de restriçãoMapa de traduçãoMapa de primersColorir alinhamento por conservaçãoColorir alinhamento por propriedadesGráfico de códonsSequência de DNA aleatóriaSequência de proteína aleatóriaDNA codificante aleatórioRegiões de DNA aleatóriasRegiões de proteína aleatóriasAmostrar DNAAmostrar proteínaEmbaralhar DNAEmbaralhar proteínaMutar DNAMutar proteínaCódigos genéticosCódigos IUPAC