コドン単位のアラインメント

2本のコード配列をコドン単位でアラインする方法

1. 2本のコード DNA 配列を、読み枠を合わせて貼り付けます。
2. 遺伝暗号とギャップペナルティを選びます。
3. アラインをクリックします。タンパク質をアラインしてギャップを DNA に戻すので、コドンが分断されません。

よくある質問

塩基ではなくコドンでアラインするのはなぜですか？

塩基のアラインメントではコドンの途中にギャップが入ることがあります。先にタンパク質をアラインすれば各コドンがそのまま保たれ、dN/dS などのコドン単位の解析に必要な形になります。

配列はアップロードされますか？

いいえ。すべてブラウザの中で動くため、配列が端末の外に出ることはありません。