Toolyard

Aligner des codons

Comment aligner deux séquences codantes par codons

  1. Collez les deux séquences d’ADN codantes, en phase.
  2. Choisissez le code génétique et les pénalités de gap.
  3. Cliquez sur Aligner. Les protéines sont alignées et les gaps reportés sur l’ADN, pour garder les codons entiers.

Questions fréquentes

Pourquoi aligner des codons plutôt que des bases ?

Un alignement de bases peut placer des gaps au milieu des codons. Aligner d’abord les protéines garde chaque codon entier, ce qu’exigent dN/dS et les autres analyses par codon.

Ma séquence est-elle envoyée ?

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