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Ferramentas de sequências de DNA e proteína

Complemento reverso DNA para RNA Combinar sequências FASTA Dividir sequência FASTA GenBank e EMBL para FASTA Extrator de features GenBank e EMBL Extrator de traduções GenBank e EMBL Dividir em códons Extrator de intervalos Extrator de janelas Limpar sequência Agrupar sequência Conversor de códigos de aminoácidos Estatísticas de DNA Estatísticas de proteína Uso de códons Localizador de ilhas CpG Peso molecular de DNA Peso molecular de proteína Ponto isoelétrico de proteína GRAVY de proteína Buscar padrão Busca aproximada Identidade e similaridade Localizador de ORF Traduzir DNA em proteína Tradução reversa Tradução reversa de um alinhamento de proteínas Análise de primers de PCR Produtos de PCR Resumo de restrição Mutar para digestão Alinhar duas sequências Alinhar códons Otimização de códons Buscador de guias CRISPR Mapa de restrição Mapa de tradução Mapa de primers Colorir alinhamento Gráfico de códons Visualizador de mapa de plasmídeo Sequência aleatória DNA codificante aleatório Regiões aleatórias Amostrar sequência Embaralhar sequência Mutar sequência Códigos genéticos Códigos IUPAC

Enzimas de restrição

Sítio de reconhecimento de AatII Sítio de reconhecimento de AccI Sítio de reconhecimento de AflII Sítio de reconhecimento de AgeI Sítio de reconhecimento de AluI Sítio de reconhecimento de ApaI Sítio de reconhecimento de ApaLI Sítio de reconhecimento de AscI Sítio de reconhecimento de AvaI Sítio de reconhecimento de AvrII Sítio de reconhecimento de BamHI Sítio de reconhecimento de BclI Sítio de reconhecimento de BglII Sítio de reconhecimento de BsiWI Sítio de reconhecimento de BspHI Sítio de reconhecimento de BsrGI Sítio de reconhecimento de BssHII Sítio de reconhecimento de BstBI Sítio de reconhecimento de ClaI Sítio de reconhecimento de DraI Sítio de reconhecimento de EagI Sítio de reconhecimento de EcoRI Sítio de reconhecimento de EcoRV Sítio de reconhecimento de FseI Sítio de reconhecimento de HaeIII Sítio de reconhecimento de HhaI Sítio de reconhecimento de HincII Sítio de reconhecimento de HindIII Sítio de reconhecimento de HinfI Sítio de reconhecimento de HpaI Sítio de reconhecimento de KpnI Sítio de reconhecimento de MfeI Sítio de reconhecimento de MluI Sítio de reconhecimento de MseI Sítio de reconhecimento de MspI Sítio de reconhecimento de NaeI Sítio de reconhecimento de NcoI Sítio de reconhecimento de NdeI Sítio de reconhecimento de NheI Sítio de reconhecimento de NotI Sítio de reconhecimento de NruI Sítio de reconhecimento de NsiI Sítio de reconhecimento de PacI Sítio de reconhecimento de PmeI Sítio de reconhecimento de PstI Sítio de reconhecimento de PvuI Sítio de reconhecimento de PvuII Sítio de reconhecimento de RsaI Sítio de reconhecimento de SacI Sítio de reconhecimento de SacII Sítio de reconhecimento de SalI Sítio de reconhecimento de Sau3AI Sítio de reconhecimento de ScaI Sítio de reconhecimento de SfiI Sítio de reconhecimento de SmaI Sítio de reconhecimento de SnaBI Sítio de reconhecimento de SpeI Sítio de reconhecimento de SphI Sítio de reconhecimento de SspI Sítio de reconhecimento de StuI Sítio de reconhecimento de SwaI Sítio de reconhecimento de TaqI Sítio de reconhecimento de XbaI Sítio de reconhecimento de XhoI Sítio de reconhecimento de XmaI

Códigos genéticos

Código genético 1: Padrão Código genético 2: Mitocondrial de vertebrados Código genético 3: Mitocondrial de leveduras Código genético 4: Mitocondrial de fungos, protozoários e celenterados; Mycoplasma Código genético 5: Mitocondrial de invertebrados Código genético 6: Nuclear de ciliados, dasicladáceas e Hexamita Código genético 9: Mitocondrial de equinodermos e platelmintos Código genético 10: Nuclear de euplotídeos Código genético 11: Bactérias, arqueias e plastídios vegetais Código genético 12: Nuclear alternativo de leveduras Código genético 13: Mitocondrial de ascídias Código genético 14: Mitocondrial alternativo de platelmintos Código genético 15: Nuclear de Blepharisma Código genético 16: Mitocondrial de clorofíceas Código genético 21: Mitocondrial de trematódeos Código genético 22: Mitocondrial de Scenedesmus obliquus Código genético 23: Mitocondrial de Thraustochytrium Código genético 24: Mitocondrial de Rhabdopleuridae Código genético 25: Divisão candidata SR1 e Gracilibacteria Código genético 26: Nuclear de Pachysolen tannophilus Código genético 29: Nuclear de Mesodinium Código genético 30: Nuclear de peritríquios Código genético 33: Mitocondrial de Cephalodiscidae

Guias

Como obter o complemento reverso de uma sequência de DNA Como traduzir DNA em proteína Como converter GenBank para FASTA Como encontrar sítios de restrição em uma sequência de DNA Como alinhar duas sequências de DNA ou de proteína Como desenhar e conferir primers de PCR Estatísticas de sequências de DNA e proteínas explicadas Como ler um arquivo GenBank Como ler um mapa de plasmídeo Como desenhar um RNA guia de CRISPR Como citar ferramentas online e software num artigo O que é o ponto isoelétrico de uma proteína?Como ler uma tabela de uso de códons Como encontrar ilhas CpG em uma sequência de DNA Como encontrar fases abertas de leitura (ORFs)Como calcular o conteúdo de GC Como calcular a porcentagem de identidade e de similaridade DNA e biologia molecular: guia de estudo Macromoléculas biológicas: guia de estudo