Visualizador de mapa de plasmídeo
Como desenhar um mapa de plasmídeo
- Cole um arquivo GenBank ou EMBL: os do Addgene, SnapGene, Benchling ou NCBI servem todos.
- O mapa circular aparece com cada característica como uma seta, e a tabela de características embaixo.
- Escolha quais sítios de restrição mostrar e baixe o mapa como SVG.
Perguntas frequentes
Que arquivos posso usar?
GenBank (.gb, .gbk) e EMBL, que é o que Addgene, SnapGene, Benchling e NCBI exportam. A sequência sozinha não basta: as características precisam estar no arquivo para haver o que desenhar.
Por que faltam algumas características?
A característica source fica de fora porque cobre todo o plasmídeo, e o que não tem localização utilizável é ignorado. Tudo que foi desenhado aparece na tabela, então você vê o que a ferramenta leu.
O que as setas querem dizer?
Cada seta é uma característica e aponta no sentido em que é lida. As que se sobrepõem vão para anéis internos para não se atropelarem, e as cores seguem o costume: azul para sequências codificantes, verde para promotores, vermelho para terminadores, violeta para origens e laranja para sítios de iniciador.
Por que só cortes únicos por padrão?
Porque são os sítios em que você realmente consegue clonar. Mostrar todos os sítios de um plasmídeo de 5 kb dá centenas de rótulos e não diz nada.
Posso editar o mapa depois?
Sim. O SVG baixado é feito de formas e texto de verdade, então Inkscape, Illustrator e Figma abrem e você pode mover rótulos ou mudar cores para uma figura.
Minha sequência é enviada?
Não. Tudo roda no seu navegador, então suas sequências nunca saem do seu dispositivo.