Visor de mapas de plásmidos
Cómo dibujar un mapa de plásmido
- Pega un archivo GenBank o EMBL: los de Addgene, SnapGene, Benchling o NCBI sirven todos.
- El mapa circular aparece con cada característica como una flecha, y la tabla de características debajo.
- Elige qué sitios de restricción mostrar y descarga el mapa como SVG.
Preguntas frecuentes
¿Qué archivos puedo usar?
GenBank (.gb, .gbk) y EMBL, que es lo que exportan Addgene, SnapGene, Benchling y el NCBI. La secuencia sola no basta: las características tienen que estar en el archivo para que haya algo que dibujar.
¿Por qué faltan algunas características?
La característica source se deja fuera porque abarca todo el plásmido, y se omite lo que no tenga una localización utilizable. Todo lo que se ha dibujado aparece en la tabla, así que puedes ver qué ha leído la herramienta.
¿Qué significan las flechas?
Cada flecha es una característica y apunta en el sentido en que se lee. Las que se solapan pasan a anillos interiores para que no se pisen, y los colores siguen la costumbre: azul para las secuencias codificantes, verde para los promotores, rojo para los terminadores, violeta para los orígenes y naranja para los sitios de cebador.
¿Por qué solo cortes únicos por defecto?
Porque son los sitios en los que de verdad puedes clonar. Mostrar todos los sitios de un plásmido de 5 kb da cientos de etiquetas y no dice nada.
¿Puedo editar el mapa después?
Sí. El SVG descargado está hecho de formas y texto de verdad, así que Inkscape, Illustrator y Figma lo abren y puedes mover etiquetas o cambiar colores para una figura.
¿Se sube mi secuencia?
No. Todo funciona en tu navegador, así que tus secuencias nunca salen de tu dispositivo.