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Buscador de islas CpG

Cómo encontrar islas CpG

  1. Pega una secuencia de ADN, como texto o en FASTA.
  2. Deja los umbrales habituales (ventana de 200 bases, al menos 50 % de GC y un CpG observado/esperado de al menos 0,6) o cámbialos.
  3. Las ventanas que los cumplen se unen en regiones, con su longitud, su contenido en GC y su CpG observado/esperado.

Preguntas frecuentes

¿Cómo se calcula el CpG observado/esperado?

El número de dinucleótidos CG por la longitud de la ventana, dividido entre el número de C por el número de G.

¿Se sube mi secuencia?

No. Todo funciona en tu navegador, así que tus secuencias nunca salen de tu dispositivo.

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