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Recherche d’îlots CpG

Comment trouver les îlots CpG

  1. Collez une séquence d’ADN, en texte ou en FASTA.
  2. Gardez les seuils habituels (fenêtre de 200 bases, au moins 50 % de GC et un CpG observé/attendu d’au moins 0,6) ou modifiez-les.
  3. Les fenêtres retenues sont fusionnées en régions, listées avec leur longueur, leur teneur en GC et leur CpG observé/attendu.

Questions fréquentes

Comment le CpG observé/attendu est-il calculé ?

Le nombre de dinucléotides CG multiplié par la longueur de la fenêtre, divisé par le nombre de C multiplié par le nombre de G.

Ma séquence est-elle envoyée ?

Non. Tout fonctionne dans votre navigateur : vos séquences ne quittent jamais votre appareil.

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